隶属于原来的防科学技术工业委员会（简称国防科工委，现在现全部并入工业和信息化部）所属七所大学之一，即哈尔滨工业大学、北京理工大学、北京航空航天大学、西北工业大学、南京理工大学、南京航空航天大学、哈尔滨工程大学。很多人知道当年的哈军工搬到长沙，成为今天的国防科技大学，但是很少人知道当年哈军工留下的海军工程系和其他系的部分专业组成的哈尔滨船舶工程学院，现在已经发展成哈尔滨工程大学，是我国“三海一核”(船舶工业、海军装备、海洋开发、核能应用)领域最大的人才培养和科学研究基地。
    哈尔滨工程大学前身是创建于1953年的中国人民解放军军事工程学院（简称“哈军工”），1970年，在“哈军工”原址，以海军工程系全建制为基础，导弹工程系、航天工程系、原子工程系、计算机系等各系(部)部分专业、教师及文革中“政治上不合格”干部教师共1500余人为基础(占当时分拆总数的51%，注：国防科大当时分得1448人)，组建哈尔滨船舶工程学院，1978年，学校再次被国务院确定为88所重点大学之一；1982年，成为首批具有博士、硕士学位授予权的单位；1994年9月学校更名为哈尔滨工程大学。

哈尔滨工程大学优势专业分布
    理科：船舶与海洋工程、导航、制导与控制、控制理论、计算机科学等