本科志愿分为一批、二批和三批。北京市实行部分平行志愿方式，即本科一、二、三批次的第二志愿实行平行志愿，从高分到低分排队进行投档。每一批次志愿填报都有需要注意的事项。
    一批本科即通常所说的“重本”，其填报关键在第一志愿，因为大部分院校只招收第一志愿。考生要详细阅读《北京市普通高等学校招生专业目录》，并注意各学校各专业对身体条件(身高、视力等)、学科条件的限制。例如，躯干或肢体残疾的考生不能填报医学类专业。部分专业只招收英语语种考生，一些学校录取时还考虑数学、语文、外语等学科的成绩，还有的学校预留计划招收第二志愿高分生。考生要阅读《部分普通高等学校在京招生章程》，了解相关要求。
    考生还要注意同一所学校不同专业录取分数的差别。例如，首都经济贸易大学2008年经济学专业录取分数线为550分以上，而信息管理与信息系统专业录取分数线为530分以上。考生报考志愿时还要考虑是否服从专业调剂。如个例一中的小A，如果服从调剂，就会被第一志愿的北京工业大学录取。
    二批本科即通常所说的“普本”。目前二批本科学校的第一志愿也非常关键，北京市许多学校一志愿即招满，连续多年未录取二志愿考生，比如北京物资学院、北京建筑工程学院等。考生在填报时如果把这些院校放在二志愿就成了无效志愿。报考二批次本科也要注意同一学校的专业级差和是否服从调剂。例如2008年北京建筑工程学院交通工程录取分数线在490分以上，而无机非金属材料专业录取分数线为455分以上。
    考生还要注意北京高校和外地高校的关系。很多考生和家长不愿报考外地院校，有的甚至宁可上本地专科，也不愿上外地本科。这是一种偏见。很多外地院校的办学质量、师资水平、办学条件都不错，而且录取分数相对较低。
    随着经济社会的发展，三批本科越来越得到认可。报考三批本科时，除了要考虑高考成绩和兴趣爱好外，由于“三本”院校学费普遍较高，考生还要考虑家庭的经济承受能力。